التمس الصندوق الفرنسي للبيئة العالمية والوكالة الفرنسية للتنمية، في إطار تمويل مشروع تطهير الناظور الكبير، من المؤسسة تنفيذ خطة شاملة لإزالة التلوث عن بحيرة مارتشيكا وحمايتها وتثمينها.

وتمثل الهدف النهائي في تحقيق جودة لمياه البحيرة تضمن على المدى الطويل إمكانية ``السباحة واستهلاك المحاريات``. ولبلوغ مستويات الجودة البيئية، وضعت خطة التدبير مخططا لإزالة التلوث الشامل والمستدام يهتم أيضا بالمناطق الواقعة ظهر الساحل والتي كانت تكب نفاياتها في البحيرة.

وقد تحقق هذا الهدف بشكل شبه كامل. وتعكف المؤسسة الآن على التحسيس والتربية على البيئة عبر برامجها المدارس الإيكولوجية، الصحفيين الشباب من أجل البيئة، المفتاح الأخضر، اللواء الأزرق. كما تعمل على جمع وتقاسم المعلومات والمعرفة حول البحيرة.